悠久の時を超え、太平洋へ再浮上した超古代文明の島”プロトゥ”――緋刻はその移動する島を「どく」で冒し、日本へ進路を向ける。この事態に自衛隊、ついで米軍も動き、現代文明VS超古代文明の戦闘が迫る。
そして島に潜入した真都たちは、緋刻を追ってプロトゥの中枢である「天の石」へ向かった。少年たちの冒険、そして戦いの結末は…？ 海洋ＳＦジュブナイル、ついに完結!!